Начальником госпиталя был назначен заместитель директора института по науке проф. С.С.Гирголав. 29.09.1941 г. он был отозван в распоряжение Санитарного управления Красной Армии и назначен заместителем главного хирурга Красной Армии.
Многие научные сотрудники института — В Г.Вайнштейн, И Е.Казакевич, В.И.Розов, М М Казаков, С.Е.Кашкаров, Я.С.Юсевич — стали ведущими хирургами ленинградских госпиталей. В августе 1941 г. директор института Ф.И.Машанский, профессора М.И.Куслик, А.А.Лимберг, Д Г.Рохлин по распоряжению санитарного отдела Северо-Западного фронта были зачислены в бригаду травматологического института по обслуживанию тыловых госпиталей и направлены в Вологду, где некоторые из них пробыли до снятия блокады.
В декабре 1941 г. директор института был вызван в Ленинград и приступил к исполнению своих обязанностей. С 20.04.1942 г. он одновременно исполнял обязанности заведующего Ленинградским городским отделом здравоохранения и оставался на этой должности до конца 1949 г., пока с связи с так называемым ленинградским делом не был сослан в Новосибирск.
Проф. А.А.Лимберг был также вызван в Ленинград, где в госпитале возглавил отделение челюстно-лицевой хирургии.
Таким образом, с первых дней войны в институте осталось только три специалиста — проф. Г.Я.Эпштейн и старшие научные сотрудники Б.В.Рубинштейн и Е.В.Баранцевич, которые по состоянию здоровья были освобождены от воинской службы. Вскоре из 1-го ЛМИ в институт перешел работать Г.Л.Эдельштейн, а из размещенного на территории института травматологического пункта переведены на работу в стационар Т.А Циммерман, Р.М.Авербух и
Н.С.Анисимов. Вот на этих врачей и легла основная нагрузка по лечению раненых
Проф. Г.Я.Эпштейн в эти годы был практически и директором института, и заместителем директора по науке, и начальником госпиталя, и заведующим одним из хирургических отделений.
Работать во время войны приходилось в тяжелейших условиях, особенно в годы блокады города. В котельной не хватало топлива, и городские власти выделили находившийся поблизости деревянный дом Из сотрудников были сформированы 3 бригады для разборки дома на топливо Строго соблюдался режим светомаскировки, на территории института не разрешалось появляться в белых халатах ни днем, ни ночью
Город постоянно подвергался артиллерийским обстрелам и налетам вражеской авиации Во время ночных воздушных налетов сотрудники дежурили на крышах здания инечитута Так, например, в ночь с 7 на 8.10 1941 г. на территорию института в течение нескольких минут упали около 40 зажигательных бомб Возникшие очаги пожара были быстро ликвидированы дежурным персоналом института. Всего за время блокады на территорию института упали и взорвались 14 крупных артиллерийских снарядов
Несмотря на тяжелейшие условия и отсутствие большинства научных сотрудников, в институте продолжалась научная работа. По данным С.Я.Фрейдлина, за военные годы были опубликованы 7 монографий, 137 статей, выполнены и защищены 8 диссертаций, из них 3 докторские. Именно в эти годы были подготовлены ставшие в последствии широко известными монография А.А.Лимберга о математических основах местной кожной пластики и монография Г Я.Эпштейна о лечении несросшихся переломов и ложных суставов длинных трубчатых костей. На госпитальной базе института проводилась подготовка медицинских кадров для нужд фронта. Только за полтора года войны здесь были подготовлены около 200 врачей-хирургов и более 300 медсестер. Самоотверженная работа сотрудников института была оценена — указом Президиума Верховного Совета СССР от 22.12.1942 г. 129 из них были награждены медалями «За оборону Ленинграда».
К концу войны положение на фронтах улучшилось, что сказалось и на жизни института С 01.03.1944 г. было отведено 20 коек для гражданских лиц, а с 15.05.1944 г. был организован амбулаторный прием пациентов. Менялся и состав больных в госпитале, постепенно он превращался в госпиталь для лечения инвалидов войны. Инвалидов было так много, что с 01.01.1944 г. в соответствии с приказом Нар-комздрава РСФСР на станции Разлив Сестро-рецкого района Ленинграда был открыт филиал института на 200 коек, который работал до 01.06.1947 г.
Начиная с 1945 г постепенно в институт стали возвращаться демобилизованные научные сотрудники — сначала женщины, а затем и мужчины. Из врачебного состава погибли только три человека — профессор-патологоанатом А.А.Васильев, научный сотрудник Н.Н.Куренков и аспирантка К.Ф.Курнатовская.
Во время войны многие сотрудники института трудились в других госпиталях Ленинграда По воспоминаниям проф В.Г.Вайнштейна, в первые дни войны главному врачу института С.Я Фрейдлину было предложено открыть госпиталь на 1000 коек для раненых «сустав-бедро» Для этого было выделено помещение бывшего Александровского лицея на Каменноостровском проспекте, в котором в советское время находилась средняя школа Как начальник госпиталя С Я Фрейдлин предложил В Г Вайнштейпу занять должность ведущего хирурга. Приняв это предложение. Владимир Григорьевич в звании военною врача 2-го ранга начал трудиться в госпитале, оставаясь заведующим хирургическим отделением института
Раненые поступали в госпиталь из центрального распределителя, который находился в Алек-сандро-Невской лавре, его начальником был главный хирург Ленинградского фронта П.А Куприянов. Поступления больных обычно были массовыми. Большинство работающих в госпитале врачей не имели опыта по военно-полевой хирургии, поэтому ведущий хирург ежедневно по утрам собирал всех врачей, анализировал обстановку в госпитале за сутки, подробно разбирал отдельные клинические случаи, стараясь передать молодым врачам свои опыт и знания
Штат медсестер прошел подготовку на специальных курсах. Персонал госпиталя находился на казарменном положении, занимая соседнее двухэтажное здание Питались сотрудники в госпитальной столовой 3 раза в день; рацион состоял из похлебки и жидкой каши, чаще всего из чечевицы Даже при таком скудном питании сотрудники госпиталя трудились в полную силу.
В январе 1942 г. в 25-градусный мороз около госпиталя упала крупная авиабомба. В одно мгновение были разбиты стекла в окнах, вышли из строя отопление, водопровод и канализация Прежде всего надо было спасать от холода раненых. Фанерой, досками, матрацами закрывали окна, больных укрывали чем могли. И все-таки двоим раненым в больших гипсовых повязках пришлось ампутировать отмороженные конечности.

В рубрике: Основные понятия и задачи